Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd4Q9CWX4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms