Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd12Q9CWU0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd12Q9CWU0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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