Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb2bQ9CWF2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb2bQ9CWF2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms