Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms