Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
Klhl28Q9CR40 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms