Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ykt6Q9CQW1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms