Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nicn1Q9CQM0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nicn1Q9CQM0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nicn1Q9CQM0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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