Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd2Q9CQ48 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms