Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms