Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl3Q99N95 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl3Q99N95 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms