Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prss29Q99MS4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss29Q99MS4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prss29Q99MS4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prss29Q99MS4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prss29Q99MS4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prss29Q99MS4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms