Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a9Q99MR3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.9 ms