Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cstf3Q99LI7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms