Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab28Q99KL7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab28Q99KL7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab28Q99KL7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab28Q99KL7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab28Q99KL7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab28Q99KL7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab28Q99KL7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab28Q99KL7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rab28Q99KL7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab28Q99KL7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms