Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EpcamQ99JW5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EpcamQ99JW5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms