Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmd6Q99JI4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms