Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf112Q96DY5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf112Q96DY5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf112Q96DY5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms