Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms