Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdhb12Q91Y07 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhb12Q91Y07 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdhb12Q91Y07 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdhb12Q91Y07 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms