Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lims2Q91XD2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lims2Q91XD2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms