Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Rprd1aQ8VDS4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rprd1aQ8VDS4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd1aQ8VDS4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms