Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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