Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms