Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B1

Plcd1, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcd1Q8R3B1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plcd1Q8R3B1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plcd1Q8R3B1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcd1Q8R3B1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcd1Q8R3B1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcd1Q8R3B1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcd1Q8R3B1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plcd1Q8R3B1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms