Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps37bQ8R0J7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps37bQ8R0J7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps37bQ8R0J7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms