Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colec12Q8K4Q8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms