Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkl1Q8K4J6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mkl1Q8K4J6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkl1Q8K4J6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkl1Q8K4J6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkl1Q8K4J6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkl1Q8K4J6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkl1Q8K4J6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkl1Q8K4J6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkl1Q8K4J6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkl1Q8K4J6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms