Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pitrm1Q8K411 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitrm1Q8K411 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitrm1Q8K411 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitrm1Q8K411 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitrm1Q8K411 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitrm1Q8K411 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitrm1Q8K411 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitrm1Q8K411 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitrm1Q8K411 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitrm1Q8K411 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitrm1Q8K411 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitrm1Q8K411 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitrm1Q8K411 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms