Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Paf1Q8K2T8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Paf1Q8K2T8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms