Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Depp1Q8K2F3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms