Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neil3Q8K203 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms