Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cog3Q8CI04 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cog3Q8CI04 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms