Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tshz3Q8CGV9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tshz3Q8CGV9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tshz3Q8CGV9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms