Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG73

Rpgrip1l, Protein fantom, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1lQ8CG73 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rpgrip1lQ8CG73 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpgrip1lQ8CG73 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1lQ8CG73 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1lQ8CG73 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1lQ8CG73 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1lQ8CG73 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1lQ8CG73 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1lQ8CG73 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1lQ8CG73 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1lQ8CG73 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1lQ8CG73 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1lQ8CG73 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1lQ8CG73 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1lQ8CG73 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpgrip1lQ8CG73 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpgrip1lQ8CG73 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms