Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brf1Q8CFK2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Brf1Q8CFK2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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