Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ercc8Q8CFD5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc8Q8CFD5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ercc8Q8CFD5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ercc8Q8CFD5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms