Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup88Q8CEC0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup88Q8CEC0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms