Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf31Q8CCF0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms