Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrip1Q8CBD1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrip1Q8CBD1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms