Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930504O13RikQ8C5Z9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms