Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc113Q8C5T8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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Ccdc113Q8C5T8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc113Q8C5T8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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