Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc169Q8BXX9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc169Q8BXX9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms