Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Iffo1Q8BXL9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Iffo1Q8BXL9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Iffo1Q8BXL9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Iffo1Q8BXL9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Iffo1Q8BXL9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iffo1Q8BXL9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Iffo1Q8BXL9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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