Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TtpaQ8BWP5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TtpaQ8BWP5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms