Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Pbrm1Q8BSQ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pbrm1Q8BSQ9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms