Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

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Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
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Tcaf1Q8BNE1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
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Tcaf1Q8BNE1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Tcaf1Q8BNE1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcaf1Q8BNE1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcaf1Q8BNE1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcaf1Q8BNE1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcaf1Q8BNE1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Tcaf1Q8BNE1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Tcaf1Q8BNE1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcaf1Q8BNE1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcaf1Q8BNE1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcaf1Q8BNE1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Tcaf1Q8BNE1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf1Q8BNE1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Tcaf1Q8BNE1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcaf1Q8BNE1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcaf1Q8BNE1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcaf1Q8BNE1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcaf1Q8BNE1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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