Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW9

Slfnl1, Schlafen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfnl1Q8BHW9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slfnl1Q8BHW9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slfnl1Q8BHW9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slfnl1Q8BHW9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slfnl1Q8BHW9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slfnl1Q8BHW9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slfnl1Q8BHW9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slfnl1Q8BHW9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slfnl1Q8BHW9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Slfnl1Q8BHW9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slfnl1Q8BHW9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfnl1Q8BHW9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slfnl1Q8BHW9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms