Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf41Q8BH75 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf41Q8BH75 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf41Q8BH75 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms