Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN9

Uncharacterized protein C1orf115 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGN9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8BGN9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8BGN9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8BGN9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGN9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8BGN9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8BGN9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGN9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms