Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG41

Psmb11, Proteasome subunit beta type-11, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb11Q8BG41 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb11Q8BG41 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb11Q8BG41 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms